Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc38a5Q3U1J0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc38a5Q3U1J0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms