Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rasip1Q3U0S6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rasip1Q3U0S6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rasip1Q3U0S6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rasip1Q3U0S6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms