Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc9Q3U0M1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc9Q3U0M1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc9Q3U0M1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trappc9Q3U0M1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms