Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Lmtk2Q3TYD6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Lmtk2Q3TYD6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lmtk2Q3TYD6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lmtk2Q3TYD6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lmtk2Q3TYD6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms