Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc17a7Q3TXX4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc17a7Q3TXX4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc17a7Q3TXX4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms