Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccndbp1Q3TVC7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccndbp1Q3TVC7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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