Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pnpla6Q3TRM4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnpla6Q3TRM4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Pnpla6Q3TRM4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pnpla6Q3TRM4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.9 ms