Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gtf3c3Q3TMP1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gtf3c3Q3TMP1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gtf3c3Q3TMP1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gtf3c3Q3TMP1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms