Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2cQ3TLH4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prrc2cQ3TLH4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc2cQ3TLH4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms