Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nlrp4cQ3TKR3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp4cQ3TKR3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms