Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc69Q3TCJ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc69Q3TCJ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms