Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prr27Q3SYJ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms