Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccbe1Q3MI99 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccbe1Q3MI99 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccbe1Q3MI99 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms