Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H2-M3Q31093 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms