Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG1

Rhox4c, MCG125587, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4cQ2MDG1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox4cQ2MDG1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4cQ2MDG1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhox4cQ2MDG1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms