Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDF8

Rhox4f, MCG113261, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4fQ2MDF8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox4fQ2MDF8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rhox4fQ2MDF8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rhox4fQ2MDF8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms