Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Samd11Q1RNF8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Samd11Q1RNF8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Samd11Q1RNF8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms