Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm1123Q1RME4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gm1123Q1RME4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm1123Q1RME4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms