Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim71Q1PSW8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim71Q1PSW8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim71Q1PSW8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim71Q1PSW8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
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