Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Myo3bQ1EG27 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Myo3bQ1EG27 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo3bQ1EG27 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo3bQ1EG27 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms