Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

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Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32,64■■■□□ 2,82
Tdrd9Q14BI7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32,62■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32,61■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32,6■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32,59■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC32,59■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32,58■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Tdrd9Q14BI7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32,54■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,54■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32,53■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32,52■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Tdrd9Q14BI7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32,5■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,49■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32,48■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32,47■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32,45■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32,45■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Tdrd9Q14BI7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32,44■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32,44■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,44■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32,44■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32,43■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32,42■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC32,41■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Tdrd9Q14BI7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,1 ms