Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rpusd2Q149F1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpusd2Q149F1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rpusd2Q149F1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms