Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Gli2Q0VGT2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Gli2Q0VGT2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Gli2Q0VGT2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Gli2Q0VGT2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Gli2Q0VGT2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Gli2Q0VGT2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms