Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc162pQ0VG85 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc162pQ0VG85 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc162pQ0VG85 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc162pQ0VG85 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms