Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc39dQ0VF76 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc39dQ0VF76 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms