Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt80Q0VBK2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt80Q0VBK2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt80Q0VBK2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms