Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Neurl1bQ0MW30 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Neurl1bQ0MW30 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurl1bQ0MW30 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms