Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttc21bQ0HA38 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttc21bQ0HA38 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttc21bQ0HA38 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttc21bQ0HA38 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ttc21bQ0HA38 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ttc21bQ0HA38 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
Ttc21bQ0HA38 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ttc21bQ0HA38 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ttc21bQ0HA38 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Ttc21bQ0HA38 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ttc21bQ0HA38 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ttc21bQ0HA38 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ttc21bQ0HA38 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ttc21bQ0HA38 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ttc21bQ0HA38 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Ttc21bQ0HA38 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Ttc21bQ0HA38 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ttc21bQ0HA38 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ttc21bQ0HA38 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ttc21bQ0HA38 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ttc21bQ0HA38 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ttc21bQ0HA38 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ttc21bQ0HA38 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ttc21bQ0HA38 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ttc21bQ0HA38 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ttc21bQ0HA38 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms