Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnnm1Q0GA42 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnnm1Q0GA42 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cnnm1Q0GA42 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnnm1Q0GA42 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms