Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700061G19RikQ08EE8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
1700061G19RikQ08EE8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
1700061G19RikQ08EE8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms