Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cab39Q06138 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cab39Q06138 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms