Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoc2Q05020 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Apoc2Q05020 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apoc2Q05020 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms