Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nf1Q04690 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nf1Q04690 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nf1Q04690 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms