Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CkbQ04447 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CkbQ04447 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CkbQ04447 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CkbQ04447 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CkbQ04447 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CkbQ04447 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CkbQ04447 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CkbQ04447 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CkbQ04447 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CkbQ04447 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CkbQ04447 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CkbQ04447 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms