Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kcnb1Q03717 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kcnb1Q03717 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms