Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tff2Q03404 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tff2Q03404 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tff2Q03404 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms