Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccl7Q03366 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl7Q03366 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms