Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Msx2Q03358 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Msx2Q03358 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Msx2Q03358 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms