Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NfiaQ02780 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NfiaQ02780 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NfiaQ02780 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms