Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ly9Q01965 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms