Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp1Q00915 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rbp1Q00915 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbp1Q00915 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms