Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga4Q00651 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga4Q00651 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms