Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pax8Q00288 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pax8Q00288 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms