Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cds1P98191 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cds1P98191 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cds1P98191 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cds1P98191 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cds1P98191 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cds1P98191 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cds1P98191 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cds1P98191 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cds1P98191 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cds1P98191 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cds1P98191 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cds1P98191 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cds1P98191 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cds1P98191 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cds1P98191 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cds1P98191 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cds1P98191 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cds1P98191 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cds1P98191 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cds1P98191 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms