Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca2P97929 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca2P97929 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brca2P97929 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brca2P97929 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brca2P97929 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Brca2P97929 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brca2P97929 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Brca2P97929 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Brca2P97929 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brca2P97929 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brca2P97929 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Brca2P97929 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Brca2P97929 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brca2P97929 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Brca2P97929 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brca2P97929 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brca2P97929 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brca2P97929 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Brca2P97929 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Brca2P97929 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brca2P97929 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Brca2P97929 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brca2P97929 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brca2P97929 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brca2P97929 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brca2P97929 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brca2P97929 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brca2P97929 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brca2P97929 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Brca2P97929 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brca2P97929 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Brca2P97929 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brca2P97929 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brca2P97929 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brca2P97929 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Brca2P97929 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Brca2P97929 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
Brca2P97929 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Brca2P97929 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca2P97929 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca2P97929 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca2P97929 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca2P97929 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca2P97929 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca2P97929 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Brca2P97929 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Brca2P97929 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brca2P97929 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brca2P97929 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Brca2P97929 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Brca2P97929 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Brca2P97929 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Brca2P97929 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Brca2P97929 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms