Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IhhP97812 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IhhP97812 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IhhP97812 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IhhP97812 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IhhP97812 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IhhP97812 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IhhP97812 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IhhP97812 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IhhP97812 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IhhP97812 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IhhP97812 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IhhP97812 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IhhP97812 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IhhP97812 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IhhP97812 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IhhP97812 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IhhP97812 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IhhP97812 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IhhP97812 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IhhP97812 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IhhP97812 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IhhP97812 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IhhP97812 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IhhP97812 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IhhP97812 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IhhP97812 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IhhP97812 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IhhP97812 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IhhP97812 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IhhP97812 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IhhP97812 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IhhP97812 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IhhP97812 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IhhP97812 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IhhP97812 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IhhP97812 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IhhP97812 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IhhP97812 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IhhP97812 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IhhP97812 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IhhP97812 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IhhP97812 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IhhP97812 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IhhP97812 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IhhP97812 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IhhP97812 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IhhP97812 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IhhP97812 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IhhP97812 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IhhP97812 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IhhP97812 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IhhP97812 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IhhP97812 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IhhP97812 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IhhP97812 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IhhP97812 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IhhP97812 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IhhP97812 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IhhP97812 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IhhP97812 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IhhP97812 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IhhP97812 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IhhP97812 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IhhP97812 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IhhP97812 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IhhP97812 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IhhP97812 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IhhP97812 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IhhP97812 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IhhP97812 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IhhP97812 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IhhP97812 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IhhP97812 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IhhP97812 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IhhP97812 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IhhP97812 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IhhP97812 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IhhP97812 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IhhP97812 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IhhP97812 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IhhP97812 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IhhP97812 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IhhP97812 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IhhP97812 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IhhP97812 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IhhP97812 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IhhP97812 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IhhP97812 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IhhP97812 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IhhP97812 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IhhP97812 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IhhP97812 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IhhP97812 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IhhP97812 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IhhP97812 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IhhP97812 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IhhP97812 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IhhP97812 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IhhP97812 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms