Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cry1P97784 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cry1P97784 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cry1P97784 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cry1P97784 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cry1P97784 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cry1P97784 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cry1P97784 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cry1P97784 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cry1P97784 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cry1P97784 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cry1P97784 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms