Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cited1P97769 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited1P97769 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited1P97769 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited1P97769 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited1P97769 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited1P97769 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cited1P97769 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited1P97769 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited1P97769 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cited1P97769 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms