Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pkp1P97350 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pkp1P97350 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pkp1P97350 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms