Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arf1P84078 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arf1P84078 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arf1P84078 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arf1P84078 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arf1P84078 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Arf1P84078 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arf1P84078 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arf1P84078 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Arf1P84078 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Arf1P84078 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Arf1P84078 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arf1P84078 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arf1P84078 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arf1P84078 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arf1P84078 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arf1P84078 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arf1P84078 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arf1P84078 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arf1P84078 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arf1P84078 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arf1P84078 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms